Les chaires d'enseignement
L'école dispose actuellement de 10 chaires d'enseignement. Chacune de ces chaires est placée sous l'autorité d'un titulaire de chaire, professeur agrégé d'une ancienneté d'au moins 4 ans au moment de sa nomination. Il est élu pour une période de 5 ans, par un quorum regroupant des autorités universitaires, académiques, ordinales et militaires. Chaque titulaire de chaire est l'interlocuteur privilégié des autorités universitaires civiles de son domaine.
Chaire de chirurgie appliquée aux armées
Titulaire : Pr Paul Balandraud, HNIA Sainte-Anne. Cette chaire regroupe les spécialités de chirurgie viscérale, thoracique et cardiovasculaire, urologique, plastique, orthopédique et traumatologique.
Chaire de médecine appliquée aux armées
Titulaire : Pr Gilles Defuentes, HNIA Sainte-Anne. Cette chaire regroupe l'ensemble des spécialités médicales hospitalières, la médecine aéronautique, la médecine hyperbare et la médecine des forces.
Chaire de Recherche appliquée aux Armées
Sous l'autorité du Pr Jean-Noël Tournier, de l'IRBA, cette chaire assure la recherche dans les domaines de physiologie intégrée, dans les neurosciences et dans les mesures médicales contre le risque NRBC.
Chaire de chirurgies spéciales
Titulaire : Pr Françoise Froussart-Maille, HNIA Percy. Cette chaire concerne les spécialités de chirurgie ophtalmo, ORL, maxillo-faciale et neurochirurgie.
Chaire d'anesthésie-réanimation et de médecine d'urgence (ARMU)
Regroupe les spécialités d'anesthésie-réanimation, de médecine périopératoire et de médecine d'urgence. Son titulaire en est le MC Pierre Pasquier, affecté aux EMSLB.
Chaire de biologie clinique appliquée aux Armées et risque biologique
Assure l’enseignement du diagnostic en microbiologie, hématologie, dans les domaines de la transfusion sanguine et de la prévention du risque infectieux. Titulaire : Pr Frédéric Janvier, HNIA Sainte-Anne.
Chaire de psychiatrie et de psychologie clinique appliquée aux armées
Psychiatrie et psychologie appliquée aux Armées. Titulaire : Pr Bertrand Lahutte, HNIA Bégin.
Chaire d'imagerie médicale appliquée aux armées et risque radionucléaire
Titulaire : Pr Jean-Christophe Amabile, SPRA. Cette chaire réunit les spécialités de radiologie, médecine nucléaire et hygiène nucléaire et radioprotection médicale.
Chaire de sciences pharmaceutiques appliquées aux armées et risque chimique
Pharmacie hospitalière, ravitaillement et risque chimique. Pr Hervé Delacour, HNIA Bégin.
Chaire d'Epidémiologie et de Santé Publique appliquée aux Armées
Enseignement et recherche dans les domaines de santé publique et d'épidémiologie, humaine et vétérinaire, médecine du travail, hygiène de l'eau et de l'alimentation. Titulaire : Pr Gaëtan Texier, CESPA.